貨物流通稅收政策主要明確了“零關(guān)稅”政策的享惠主體，以及貨物進(jìn)出海南自由貿(mào)易港與中華人民共和國(guó)關(guān)境外其他國(guó)家和地區(qū)之間（“一線”）、海南自由貿(mào)易港與中華人民共和國(guó)關(guān)境內(nèi)其他地區(qū)（內(nèi)地）之間（“二線”），以及在海南自由貿(mào)易港島內(nèi)流通的稅收政策等。

“零關(guān)稅”政策的享惠主體包括三類：一是在海南自由貿(mào)易港登記注冊(cè)且具有獨(dú)立法人資格的企業(yè)；二是海南自由貿(mào)易港內(nèi)的事業(yè)單位；三是由科技部、教育部會(huì)同民政部（或省級(jí)科技、教育主管部門會(huì)同省級(jí)民政部門）核定，并在海南自由貿(mào)易港登記的科技類、教育類民辦非企業(yè)單位。符合上述條件的市場(chǎng)主體，可根據(jù)自身生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)情況，自愿提出享惠主體認(rèn)定申請(qǐng)；經(jīng)認(rèn)定后，即可按規(guī)定享受相關(guān)“零關(guān)稅”政策。

“一線”進(jìn)口實(shí)行進(jìn)口征稅商品目錄管理。除國(guó)家規(guī)定禁止進(jìn)口以及國(guó)家法律、行政法規(guī)明確規(guī)定不予免稅或保稅的貨物外，在“一線”對(duì)進(jìn)口征稅貨物實(shí)施目錄管理。目錄內(nèi)的進(jìn)口貨物，照章征收進(jìn)口關(guān)稅、進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅和消費(fèi)稅；享惠主體進(jìn)口征稅商品目錄以外的貨物，免征進(jìn)口關(guān)稅、進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅和消費(fèi)稅。

經(jīng)“二線”進(jìn)入內(nèi)地須補(bǔ)繳進(jìn)口稅收。“零關(guān)稅”貨物及其加工制成品經(jīng)“二線”進(jìn)入內(nèi)地，按進(jìn)口料件的相關(guān)規(guī)定補(bǔ)繳進(jìn)口關(guān)稅、進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅和消費(fèi)稅；對(duì)鼓勵(lì)類產(chǎn)業(yè)企業(yè)生產(chǎn)的含進(jìn)口料件且在海南自由貿(mào)易港加工增值超過30%（含）的貨物，經(jīng)“二線”進(jìn)入內(nèi)地免征進(jìn)口關(guān)稅，但照章征收進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅和消費(fèi)稅。

在海南自由貿(mào)易港內(nèi)，享惠主體間流通免于補(bǔ)繳進(jìn)口稅收?！傲汴P(guān)稅”貨物及其加工制成品在符合條件的享惠主體間流通，免于補(bǔ)繳進(jìn)口關(guān)稅、進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅和消費(fèi)稅，但照章征收國(guó)內(nèi)環(huán)節(jié)增值稅和消費(fèi)稅。若享惠主體將“零關(guān)稅”貨物及其加工制成品流通至海南自由貿(mào)易港內(nèi)的非享惠主體或個(gè)人，則須補(bǔ)繳進(jìn)口關(guān)稅、進(jìn)口環(huán)節(jié)增值稅和消費(fèi)稅，并照章征收國(guó)內(nèi)環(huán)節(jié)增值稅和消費(fèi)稅。

此外，貨物流通稅收政策還明確：內(nèi)地經(jīng)“二線”進(jìn)入海南自由貿(mào)易港的貨物，按國(guó)內(nèi)流通管理；從海南自由貿(mào)易港經(jīng)“一線”離境的貨物，按出口管理。